BIoinformatika
Nájsť presnú a úplnú odpoveď na otázku, čo je to bioinformatika, nie je jednoduché. V prvom priblížení, tak ako vyplýva z názvu, bioinformatika je vedou na rozhraní biológie a informatiky. Presnejšie však ide o disciplínu, ktorá pomocou metód a prístupov vychádzajúcich z aplikovanej matematiky, štatistiky, informatiky a iných počítačových vied rieši biologické problémy, predovšetkým na molekulárnej úrovni.
Bioinformatiku možno v širšom zmysle slova chápať ako akékoľvek použitie výpočtovej techniky pri riešení biologických problémov. U užšom zmysle slova je bioinformatika spájaná iba s vývojom softvéru na automatizovanú analýzu biologických dát. V roku 2000 zverejnil Národný inštitút zdravia USA (NIH) tzv. pracovnú verziu definície bioinformatiky a počítačovej biológie podľa ktorej : bioinformatika zahŕňa výskum, vývoj a aplikáciu výpočtových nástrojov a prístupov vedúcich k rozširovaniu využítia dát z oblasti biologických, medicínskych, behaviorálnych vied a zdravotníctva; vrátane nástrojov a prístupov slúžiacich na získavanie, uchovávanie, organizáciu, archiváciu, analýzu a vizualizáciu takýchto dát.
Vo všeobecnosti však môžeme definovať tri hlavné úlohy bioinformatiky:
- Tvorba a správa databáz biologických dát rôzneho charakteru (DNA, RNA alebo proteínové sekvencie, proteínové štruktúry, génové expresné profily, atď.)
- Tvorba algoritmov a matematických modelov určených na analýzu biologických dát
- Aplikácia bioinformatických nástrojov za účelom interpretácie týchto dát vo svetle biologických súvislostí.
V oblasti výskumu bioinformatika zahŕňa: zoradenie sekvencií (sequence alignment), identifikáciu sekvenčných homológií, lokalizáciu génov ako aj špecifických sekvenčných motívov a vzorov v rámci sekvencií, mapovanie genómov, predpovedanie a určovanie štruktúry proteínov, predpovedanie a analýzu medzimolekulových interakcií, analýzu génových expresných dát či molekulárnu fylogenetiku a i.